RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM235A6NFC5 223 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF823P16415 610 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMB6P28072 239 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RPRMLQ8N4K4 120 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3IP1Q96FE7 263 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CST11Q9H112 138 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB27BO00194 218 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPP3O14495 311 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP7O14520 342 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF224P0DH78 156 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG16Q8N0X2 631 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5AP2Q8NGF4 316 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF141Q8WVD5 230 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL11Q969Q4 196 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RELTQ969Z4 430 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
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CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPB13A6NJU9 1138 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 DBX1A6NMT0 343 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPB4C9JG80 1138 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF208O43345 1280 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 BDKRB2P30411 391 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GFRA1P56159 465 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SPOCK1Q08629 439 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf140Q5VVS0 124 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A36Q96CQ1 311 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC22AQ96IW7 307 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CRHP06850 196 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CD79AP11912 226 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CTAG1AP78358 180 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MOGAT2Q3SYC2 334 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 AWAT2Q6E213 333 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CORO6Q6QEF8 472 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 GRINAQ7Z429 371 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A24Q8N4F4 322 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1S2Q8NGQ3 325 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R14AQ96A00 147 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGES2Q9H7Z7 377 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ALKBH4Q9NXW9 302 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED7Q9Y3B3 224 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 BAHCC1Q9P281 2608 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0B4J2A0 478 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNA6P05013 189 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP16P51512 607 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SCRN3Q0VDG4 424 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM189A2Q15884 450 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa23■■□□□ 1.27
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR51A2Q8NGJ7 313 aa23■■□□□ 1.27
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CAPNS1-201ENST00000246533 MBD2Q9UBB5 411 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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CAPNS1-201ENST00000246533 PLGP00747 810 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ZP4Q12836 540 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 NKPD1Q17RQ9 610 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MICBQ29980 383 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 RAET1LQ5VY80 246 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 IL34Q6ZMJ4 242 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MISPQ8IVT2 679 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CCSO14618 274 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT14O95848 222 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 OPN1LWP04000 364 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 IL11P20809 199 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CA7P43166 264 aa22.99■■□□□ 1.27
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CAPNS1-201ENST00000246533 SHEQ5VZ18 495 aa22.99■■□□□ 1.27
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CAPNS1-201ENST00000246533 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 DRAM2Q6UX65 266 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 BAP18Q8IXM2 172 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ACBD4Q8NC06 268 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A10Q8NG04 563 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4S1Q8NGB4 309 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4D6Q8NGJ1 314 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 POC1BQ8TC44 478 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR119Q8TDV5 335 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRM2P08172 466 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PLPPR5Q32ZL2 321 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF585AQ6P3V2 769 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ST7LQ8TDW4 575 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 MLXQ9UH92 298 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAPINO95295 136 aa22.98■■□□□ 1.27
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