RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 SOX7Q9BT81 388 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NLKQ9UBE8 527 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 UPB1Q9UBR1 384 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C5orf63A6NC05 138 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ARSBP15848 533 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF32P17041 273 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CDKN1AP38936 164 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GDNFP39905 211 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RANBP1P43487 201 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PCBD1P61457 104 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DRAM2Q6UX65 266 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PGAP1Q75T13 922 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF627Q7L945 461 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KRT74Q7RTS7 529 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 COMMD2Q86X83 199 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CDH26Q8IXH8 852 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR52I2Q8NH67 350 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PTX4Q96A99 478 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 LYZL4Q96KX0 146 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KCNK15Q9H427 330 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 A0A0B4J293 547 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GGT3PA6NGU5 568 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ORC5O43913 435 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KRT33AO76009 404 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DBHP09172 617 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CD40P25942 277 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ATP5J2P56134 94 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CARTPTQ16568 116 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR5AS1Q8N127 324 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR52N4Q8NGI2 321 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SLC7A6Q92536 515 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 HPS1Q92902 700 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DIABLOQ9NR28 239 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 V9GYS6 101 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NDUFS7O75251 213 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MPGP29372 298 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SLC6A9P48067 706 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF774Q6NX45 483 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 AKAP14Q86UN6 197 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SKA3Q8IX90 412 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 UPRTQ96BW1 309 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 WNT5BQ9H1J7 359 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CENPXA8MT69 81 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 E7EQL1 145 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DHRS3O75911 302 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 LY6G6DO95868 133 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RAB6AP20340 208 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TPTEP56180 551 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PSG4Q00888 419 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CR1P17927 2039 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 A0A0A6YYH2 397 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 A6NJ64 397 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 M0R1B8 84 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ALDOBP05062 364 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TRAPPC2P0DI81 140 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 THBS4P35443 961 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SSX8Q7RTT4 187 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DTX2Q86UW9 622 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C10orf35Q96D05 121 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR10A2Q9H208 303 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KDM4BO94953 1096 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXC6-201ENST00000243108 ALX3O95076 343 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms