RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640511.1

SPIN3-241, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 3,102 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-241ENST00000640511 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TBPL1P62380 186 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM156Q8N614 296 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF740Q8NDX6 193 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 OR51A4Q8NGJ6 313 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 UBE2E3Q969T4 207 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 WDR34Q96EX3 536 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ST3GAL6Q9Y274 331 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 MED31Q9Y3C7 131 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 YIPF1Q9Y548 306 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 K7ERU9 68 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 K7N7A8 449 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 DEDDO75618 318 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 FZD2Q14332 565 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 CDKN3Q16667 212 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 EXD3Q8N9H8 876 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 OR4D5Q8NGN0 318 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 OR10AC1Q8NH08 325 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 LOXL4Q96JB6 756 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 VAMP8Q9BV40 100 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 MS4A8Q9BY19 250 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 LHX3Q9UBR4 397 aa10.44□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 SCN5AQ14524 2016 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 CDC14CA4D256 554 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 MMP23AO75900 390 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 KNG1P01042 644 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 STAG3L3P0CL85 134 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 PTGER1P34995 402 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 IL24Q13007 206 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 KRTCAP3Q53RY4 240 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 NPEPL1Q8NDH3 523 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 PAAF1Q9BRP4 392 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 CTDSP1Q9GZU7 261 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 C5orf66Q9H5L9 145 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 LAMP3Q9UQV4 416 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 PRR32B1ATL7 298 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 UPK3AO75631 287 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 OR6A2O95222 327 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 IGLV3-27P01718 113 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ACRP10323 421 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TUBG1P23258 451 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ARF6P62330 175 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 SCGB2A2Q13296 93 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ICAM4Q14773 271 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF684Q5T5D7 378 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TEX43Q6ZNM6 134 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF550Q7Z398 422 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF595Q8IYB9 648 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ZNRF4Q8WWF5 429 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TMEM230Q96A57 120 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 MAGT1Q9H0U3 335 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 SERTAD3Q9UJW9 196 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 GPR132Q9UNW8 380 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 SLC5A6Q9Y289 635 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10.43□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 A0A1B0GTH9 108 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 WDR1O75083 606 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 MTX2O75431 263 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 B3GAT3O94766 335 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 CTSAP10619 480 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 CLDN6P56747 220 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 GNB2P62879 340 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 FAM166AQ6J272 317 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 LCN10Q6JVE6 187 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 OR8G5Q8NG78 346 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 IL22RA2Q969J5 263 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 RSPRY1Q96DX4 576 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 IL17FQ96PD4 163 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 OR7D2Q96RA2 312 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 CCKBRP32239 447 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 SLC11A1P49279 550 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 CLDN18P56856 261 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 ZNF506Q5JVG8 444 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 GLYATL3Q5SZD4 288 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 PRR27Q6MZM9 219 aa10.42□□□□□ -0.74
SPIN3-241ENST00000640511 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms