RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR2M3Q8NG83 312 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 DEFA4P12838 97 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RAB13P51153 203 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MLF1P58340 268 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R45P59539 299 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CD226Q15762 336 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 LINC00596Q86U02 117 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RDH5Q92781 318 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SPACA5Q96QH8 159 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ALX3O95076 343 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PDGFAP04085 211 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PRDX4Q13162 271 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CBLN3Q6UW01 205 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FAHD2AQ96GK7 314 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ARV1Q9H2C2 271 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 AK3Q9UIJ7 227 aa5.76□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SSSCA1O60232 199 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF32P17041 273 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FOXC1Q12948 553 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ADGRG3Q86Y34 549 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf40Q8IXQ3 194 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TXN2Q99757 166 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 DDA1Q9BW61 102 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 KLK11Q9UBX7 282 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0U1RQK1 487 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TO15178 435 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 KLK10O43240 276 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SPNP16150 400 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 NTNG2Q96CW9 530 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PSENENQ9NZ42 101 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RNF24Q9Y225 148 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RER1O15258 196 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 LIFP15018 202 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CTLA4P16410 223 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF774Q6NX45 483 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FAM122BQ7Z309 247 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR13G1Q8NGZ3 307 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PTDSS2Q9BVG9 487 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TAAR3PQ9P1P4 343 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SFT2D2O95562 160 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OPRM1P35372 400 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RAB7AP51149 207 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 NXPH3O95157 252 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CNIH1O95406 144 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB25P24278 435 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 BPIFB3P59826 476 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 AVPI1Q5T686 147 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MED30Q96HR3 178 aa5.75□□□□□ -1.49
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