RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635841.1

XIST-211, X inactive specific transcript, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene XIST, Length 1,734 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIST-211ENST00000635841 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 SLC25A28Q96A46 364 aa7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 RFT1Q96AA3 541 aa7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 TMEM100Q9NV29 134 aa7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 OR5V1Q9UGF6 321 aa7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 DUSP13Q9UII6 198 aa7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 SPATA2Q9UM82 520 aa7.57□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.56□□□□□ -1.2
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XIST-211ENST00000635841 FAM25GB3EWG6 89 aa7.56□□□□□ -1.2
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XIST-211ENST00000635841 S100ZQ8WXG8 99 aa7.56□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.56□□□□□ -1.2
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XIST-211ENST00000635841 SYT3Q9BQG1 590 aa7.56□□□□□ -1.2
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XIST-211ENST00000635841 CA10Q9NS85 328 aa7.56□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 ETV7Q9Y603 341 aa7.56□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 VSTM5A8MXK1 200 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 SHISA9B4DS77 424 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 ZNF732B4DXR9 585 aa7.55□□□□□ -1.2
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XIST-211ENST00000635841 IGHV3-13P01766 116 aa7.55□□□□□ -1.2
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XIST-211ENST00000635841 BMP4P12644 408 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 ELK1P19419 428 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 PTGFRP43088 359 aa7.55□□□□□ -1.2
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XIST-211ENST00000635841 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 WDFY2Q96P53 400 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 S100A13Q99584 98 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 MICU1Q9BPX6 476 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 SLC22A4Q9H015 551 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 HMG20AQ9NP66 347 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 ING4Q9UNL4 249 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 PLSCR5A0PG75 271 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 OR5B21A6NL26 309 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 PLATP00750 562 aa7.55□□□□□ -1.2
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XIST-211ENST00000635841 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 OR4A8P0C604 315 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 UBBP0CG47 229 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 EVX1P49640 407 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 ART1P52961 327 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 GNG3P63215 75 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 CNIH2Q6PI25 160 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 Q6ZR03 302 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 CCDC190Q86UF4 302 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 FAM222BQ8WU58 562 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 CMTM3Q96MX0 182 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
XIST-211ENST00000635841 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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