RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608440.5

CTCFL-218, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 2,749 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-218ENST00000608440 PLPP4Q5VZY2 271 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 NUP54Q7Z3B4 507 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SLC16A11Q8NCK7 471 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 ADAMTS15Q8TE58 950 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SLC35A4Q96G79 324 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 MEMO1Q9Y316 297 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 CHD9Q3L8U1 2897 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 A0A1B0GUS0 222 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TSPAN2O60636 221 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 C1orf105O95561 183 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 UBE2V1Q13404 147 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 CST9LP1Q5W188 147 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 HOGA1Q86XE5 327 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 AQP3Q92482 292 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TECTBQ96PL2 329 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 RNF2Q99496 336 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 FUT9Q9Y231 359 aa11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 C5orf42Q9H799 3197 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 A8MVM7 634 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 XRCC2O43543 280 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 GNB3P16520 340 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 RABIFP47224 123 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 FOXF1Q12946 379 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 IL15RAQ13261 267 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 FZD2Q14332 565 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 ICAM4Q14773 271 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 PCK2Q16822 640 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 MPV17LQ2QL34 196 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 ZNF260Q3ZCT1 412 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 MCHR2Q969V1 340 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 MS4A10Q96PG2 267 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 LYSMD1Q96S90 227 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 LPAR4Q99677 370 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 NUDT9Q9BW91 350 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SRD5A3Q9H8P0 318 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 HIDE1A8MVS5 230 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 C17orf105B2RV13 164 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 DEDDO75618 318 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 KNG1P01042 644 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 GLRA1P23415 457 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 RAB11AP62491 216 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 ASPHD2Q6ICH7 369 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 WDR34Q96EX3 536 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 ALG12Q9BV10 488 aa11.13□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SCDO00767 359 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TBL1XO60907 577 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 CHRM2P08172 466 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SSR2P43308 183 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 RND2P52198 227 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 PLAURQ03405 335 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SPOCK1Q08629 439 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SQSTM1Q13501 440 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TMEM123Q8N131 208 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TOMM40LQ969M1 308 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 WBP2Q969T9 261 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TIFAQ96CG3 184 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 CYYR1Q96J86 154 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 MS4A8Q9BY19 250 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 CNTD2Q9H8S5 307 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 GPR132Q9UNW8 380 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SLC22A13Q9Y226 551 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 PPP5D1E7EU14 171 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 K7N7A8 449 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 TBX19O60806 448 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 NGFRP08138 427 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 P2RY1P47900 373 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 SPINT3P49223 89 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 RPL19P84098 196 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa11.12□□□□□ -0.63
CTCFL-218ENST00000608440 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms