RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602190.1

IRF3-231, Transcript of interferon regulatory factor 3, human

TSL 3

Gene IRF3, Length 413 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF3-231	ENST00000602190	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SP140L	Q9H930	580 aa		14.74	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ODF3B	A8MYP8	253 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	TBX1	O43435	398 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	APOC1	P02654	83 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	FMO3	P31513	532 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GNAL	P38405	381 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OPRL1	P41146	370 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	KRTAP10-11	P60412	298 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	PRDX4	Q13162	271 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190		Q6ZS46	218 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	FTMT	Q8N4E7	242 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		14.73	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	RHBDL1	O75783	438 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	COX4I1	P13073	169 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	SPI1	P17947	270 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CD33	P20138	364 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	HMGA2	P52926	109 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	DLX6	P56179	175 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	TAF13	Q15543	124 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GLYAT	Q6IB77	296 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	FAM57B	Q71RH2	274 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	B9D2	Q9BPU9	175 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	ABHD6	Q9BV23	337 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OR51I2	Q9H344	312 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		14.72	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GLRA1	P23415	457 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	IFNGR2	P38484	337 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	BLVRA	P53004	296 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	GMFB	P60983	142 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CRMP1	Q14194	572 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	KRT72	Q14CN4	511 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	CALHM1	Q8IU99	346 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	LYZL4	Q96KX0	146 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	AMELY	Q99218	206 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	OR10A2	Q9H208	303 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		14.71	□□□□□ -0.05
IRF3-231	ENST00000602190	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	C17orf98	A8MV24	154 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	GYPB	P06028	91 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	CLU	P10909	449 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF626	Q68DY1	528 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	ITFG2	Q969R8	447 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	PYURF	Q96I23	114 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	RNF170	Q96K19	258 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	USE1	Q9NZ43	259 aa		14.7	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	GLCE	O94923	617 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	POU1F1	P28069	291 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	CD177	Q8N6Q3	437 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	MALSU1	Q96EH3	234 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	RASL12	Q9NYN1	266 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		14.69	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	RBP4	P02753	201 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	CCL3L1	P16619	93 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	HSD11B1	P28845	292 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	RRM2	P31350	389 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	GABRA2	P47869	451 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	RAB13	P51153	203 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	ERVFRD-1	P60508	538 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	BLCAP	P62952	87 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	SLC35A2	P78381	396 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	COL10A1	Q03692	680 aa		14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
IRF3-231	ENST00000602190	ZNF273	Q14593	569 aa		14.68	□□□□□ -0.06

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