RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 RGCCQ9H4X1 137 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 NLKQ9UBE8 527 aa20.89■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM183AA6NL82 134 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CST4P01036 141 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 POU1F1P28069 291 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 DCTDP32321 178 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DS4P43632 304 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM189A2Q15884 450 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 SNCBQ16143 134 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM76BQ5HYJ3 339 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CRIP3Q6Q6R5 217 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4C13Q8NGP0 309 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 LYZL4Q96KX0 146 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CDRT15Q96T59 188 aa20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2AT4A6NND4 320 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNGP01579 166 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 H2BFMP0C1H6 154 aa20.87■□□□□ 0.93
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CAPNS1-211ENST00000590874 BLMHQ13867 455 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNRF1Q8ND25 227 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGCQ92535 297 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF170Q96K19 258 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCB9Q9NP78 766 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 VNN3Q9NY84 501 aa20.87■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MEGF11A6BM72 1044 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 RIIAD1A6NNX1 92 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YAE9 185 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPTL7O43827 346 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 RHBDL1O75783 438 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF3P17036 446 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRA2P47869 451 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf88Q6PI97 169 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 TIGD4Q8IY51 512 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM234AQ9H0X4 552 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CMC2Q9NRP2 79 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF222Q9UK12 451 aa20.86■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PIN1P1O15428 100 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 GLRA1P23415 457 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA2P43356 314 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM185AQ8N0U4 392 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5D13Q8NGL4 314 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2T6Q8NHC8 308 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM107BQ9H098 131 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MEGF9Q9H1U4 602 aa20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST1O43916 411 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PSG2P11465 335 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1B2P21281 511 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2R1Q6VVX0 501 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 SHFQ7M4L6 423 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 LYG1Q8N1E2 194 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM185AQ8NFB2 350 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 OTULINQ96BN8 352 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 DGCR6LQ9BY27 220 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 C19orf12Q9NSK7 152 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 U3KQV3 271 aa20.84■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 GLCEO94923 617 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 ALX3O95076 343 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 VSIG10L2P0DP72 767 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 GPM6AP51674 278 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 MKXQ8IYA7 352 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8B12Q8NGG6 310 aa20.83■□□□□ 0.93
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MICAQ29983 383 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 REC114Q7Z4M0 266 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 OTOSQ8NHW6 89 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51I2Q9H344 312 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB18Q9NP72 206 aa20.82■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX3O60493 162 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENOFO60613 162 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 LYNP07948 512 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 AANATQ16613 207 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 DMRTC1Q5HYR2 192 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PIFOQ8TCI5 191 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 THEM6Q8WUY1 208 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SDSLQ96GA7 329 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 OR51V1Q9H2C8 321 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 YY1AP1Q9H869 796 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 BMXP51813 675 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 OXLD1Q5BKU9 147 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP78Q5JTW2 689 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB107AQ8IZN7 70 aa20.8■□□□□ 0.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20.8■□□□□ 0.92
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