RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CATSPER2	Q96P56	530 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CYTH2	Q99418	400 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CD300A	Q9UGN4	299 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608		A8MU10	97 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SMLR1	H3BR10	107 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SOCS1	O15524	211 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	YIF1A	O95070	293 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ADRA2A	P08913	450 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	GIMD1	P0DJR0	217 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	UGT2B10	P36537	528 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MAGEA3	P43357	314 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR12D2	P58182	307 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NAB1	Q13506	487 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TPBG	Q13641	420 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608		Q6ZSR6	202 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MDP1	Q86V88	176 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	COMTD1	Q86VU5	262 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ACOT9	Q9Y305	439 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TNS2	Q63HR2	1409 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM223	A0PJW6	202 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ISPD	A4D126	451 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR5H1	A6NKK0	313 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MANBA	O00462	879 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MYL12B	O14950	172 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PSPHP1	O15172	72 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CETN3	O15182	167 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	RCBTB2	O95199	551 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MT-ND4	P03905	459 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CCL15	Q16663	113 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF691	Q5VV52	312 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC01551	Q86U37	167 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	GAPT	Q8N292	157 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608		Q8N7P7	452 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NT5C	Q8TCD5	201 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	DOK4	Q8TEW6	326 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	GTF2H4	Q92759	462 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	S100PBP	Q96BU1	408 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SERPINB11	Q96P15	392 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	EMC6	Q9BV81	110 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SCML1	Q9UN30	329 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608		F8VP50	259 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608		M0QXV9	152 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CHST10	O43529	356 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	NDUFS5	O43920	106 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC22	O60826	627 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SCN2B	O60939	215 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGLV2-8	P01709	118 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGLV3-25	P01717	112 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CD8A	P01732	235 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	GP1BA	P07359	652 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	KDSR	Q06136	332 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	PMVK	Q15126	192 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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