RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 A0A1B0GTI1 187 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM210A6NLX4 147 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CD300LBA8K4G0 201 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PRR32B1ATL7 298 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 AIPO00170 330 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SULT1B1O43704 296 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SMPD2O60906 423 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CDRT1O95170 752 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NRASP01111 189 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ADRA2AP08913 450 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 DBHP09172 617 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CALCBP10092 127 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PF4V1P10720 104 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF250P15622 560 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 KITLGP21583 273 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SDC2P34741 201 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TALDO1P37837 337 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RBP2P50120 134 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ATP1B3P54709 279 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 DDI2Q5TDH0 399 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SLC22A25Q6T423 547 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF573Q86YE8 665 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 Q8IYB0 196 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 S100ZQ8WXG8 99 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ERGIC1Q969X5 290 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PTX4Q96A99 478 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PHF21AQ96BD5 680 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NOX3Q9HBY0 568 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0A6YYH2 397 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0B4J203 849 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 WIPF3A6NGB9 483 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 A6NJ64 397 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 J3QKU1 62 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZG16O60844 167 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CLPXO76031 633 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3-13P01766 116 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 HCKP08631 526 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MED14OSP0DP75 135 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SLC2A1P11166 492 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PSKH1P11801 424 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ATF1P18846 271 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.43e-11■■■■□ 21.8
SMAD4-210ENST00000590061 SOX2P48431 317 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 VBP1P61758 197 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GNG3P63215 75 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FAM3AP98173 230 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF92Q03936 586 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RAB11BQ15907 218 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 IGFBP7Q16270 282 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF404Q494X3 552 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM42Q69YG0 159 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 RAB12Q6IQ22 244 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF529Q6P280 563 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MKXQ8IYA7 352 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 OR8S1Q8NH09 359 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 MCFD2Q8NI22 146 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMAD4-210ENST00000590061 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.29□□□□□ -1.4
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