RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-209	ENST00000587215	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215		A0A0U1RQV5	110 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	RHBDL1	O75783	438 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	NDUFA7	O95182	113 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	IGLV3-1	P01715	115 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	MAP2K3	P46734	347 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	GPM6A	P51674	278 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	RAG2	P55895	527 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	DLX1	P56177	255 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	TREML4	Q6UXN2	200 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	OR4F5	Q8NH21	305 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	DYRK2	Q92630	601 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	GAFA1	Q96PS6	74 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	OR51I2	Q9H344	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF732	B4DXR9	585 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	KCNAB3	O43448	404 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	PRKY	O43930	277 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	EFNB1	P98172	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ROM1	Q03395	351 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	TNFRSF14	Q92956	283 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	MED30	Q96HR3	178 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	MRO	Q9BYG7	248 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	OR2AT4	A6NND4	320 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	GSC2	O15499	205 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	GPR137B	O60478	399 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	KNG1	P01042	644 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	GLRA1	P23415	457 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	KRTAP10-3	P60369	221 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	GNG3	P63215	75 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	SIGLEC5	O15389	551 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF254	O75437	659 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	PSG2	P11465	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ATP6V1B1	P15313	513 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	EPHA2	P29317	976 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	MOB3C	Q70IA8	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	LINC01006	Q8NI28	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PKN1-209	ENST00000587215		A0A1W2PRD5	423 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms