RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 TMEM210A6NLX4 147 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CCRL2O00421 344 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SLC22A2O15244 555 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 TYROBPO43914 113 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 RBP4P02753 201 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CRABP1P29762 137 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 POU3F4P49335 361 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ARHGDIBP52566 201 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 NFYCQ13952 458 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SLC36A3Q495N2 470 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 TEX38Q6PEX7 206 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 DRAM2Q6UX65 266 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CCDC80Q76M96 950 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 IFT20Q8IY31 132 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 DRAM1Q8N682 238 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 TSSK2Q96PF2 358 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 A8MZ25 164 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SLC1A7O00341 560 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 DCTN6O00399 190 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SOCS2O14508 198 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 UBDO15205 165 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ZNF728P0DKX0 622 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 TNFRSF1BP20333 461 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CNTFRP26992 372 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 HTR1DP28221 377 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ACTA2P62736 377 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ACTG2P63267 376 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ACTC1P68032 377 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ACTA1P68133 377 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 FAM3AP98173 230 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ST3GAL3Q11203 375 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 FHL3Q13643 280 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CYP51A1Q16850 503 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ADCK1Q86TW2 530 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 NRMQ8IXM6 262 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ZNF561Q8N587 486 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SPSB4Q96A44 273 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 BIRC5O15392 142 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 TBX1O43435 398 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SAP30O75446 220 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 MED14OSP0DP75 135 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SLC2A1P11166 492 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ZNF823P16415 610 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 PRKCDQ05655 676 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 STX3Q13277 289 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SNCBQ16143 134 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 HAGHQ16775 308 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 ZBED5Q49AG3 693 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CBLL1Q75N03 491 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 LYPD6Q86Y78 171 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 STPG2Q8N412 459 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CD177Q8N6Q3 437 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 OR11H1Q8NG94 326 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SP140LQ9H930 580 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 DPM3Q9P2X0 92 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 B9D1Q9UPM9 204 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-212ENST00000582376 MUC4Q99102 2169 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms