RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 SLC36A2Q495M3 483 aa4.01□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.01□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 SPRNQ5BIV9 151 aa4.01□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 ELFN2Q5R3F8 820 aa4.01□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 KRT80Q6KB66 452 aa4.01□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 FAHD1Q6P587 224 aa4.01□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 LRRC18Q8N456 261 aa4.01□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 M0QZ24 198 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 RER1O15258 196 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 SSX4O60224 188 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 ADRA2AP08913 450 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 CLUP10909 449 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 STOMP27105 288 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 SLC6A6P31641 620 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 ATP6AP1Q15904 470 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 SLC36A3Q495N2 470 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 LEG1Q6P5S2 330 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 ARMC1Q9NVT9 282 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 DNAJB9Q9UBS3 223 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 ATPIF1Q9UII2 106 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 POU2F3Q9UKI9 436 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 FBXL3Q9UKT7 428 aa4□□□□□ -1.77
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PRPF8-211ENST00000574728 STARD10Q9Y365 291 aa4□□□□□ -1.77
PRPF8-211ENST00000574728 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
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