RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR6F1Q8NGZ6 308 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR56B4Q8NH76 319 aa24.57■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A0A6YYD4 124 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TNFSF13O75888 250 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBP2P50120 134 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 FUT6P51993 359 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 MTCP1P56278 107 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLRB1Q12918 225 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDNFQ49AH0 187 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 DMRTC1Q5HYR2 192 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q6ZTK2 550 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 GABRG1Q8N1C3 465 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM229BQ8NBD8 167 aa24.56■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 C7orf66A4D0T2 115 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ICMTO60725 284 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCNKO75909 580 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CGAP01215 116 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXF2Q12947 444 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC22A6Q4U2R8 563 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 RTL6Q6ICC9 239 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR56B1Q8NGI3 324 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TM2D1Q9BX74 207 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ING4Q9UNL4 249 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 STARD10Q9Y365 291 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM235A6NFC5 223 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKAIN1P0CW23 69 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 GTF3C1Q12789 2109 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC30A7Q8NEW0 376 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 STEAP2Q8NFT2 490 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5D18Q8NGL1 313 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 BORCS8Q96FH0 119 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF170Q96K19 258 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 NICN1Q9BSH3 213 aa24.55■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 NGFP01138 241 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 H2AFB2P0C5Z0 115 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 WNT5AP41221 380 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAS2R19P59542 299 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM180AQ6UWF9 173 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHST4Q8NCG5 386 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CMBLQ96DG6 245 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 STARD4Q96DR4 205 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 MS4A3Q96HJ5 214 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 S100A13Q99584 98 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 SELENOIQ9C0D9 397 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 BANF2Q9H503 90 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC7A11Q9UPY5 501 aa24.54■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRAV6A0A075B6T7 132 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAD51DO75771 328 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CST4P01036 141 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRSS12P56730 875 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR4C16Q8NGL9 310 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 BSNQ9UPA5 3926 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATRXP46100 2492 aa24.53■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PP11 408 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 LYZL6O75951 148 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 GTF2F2P13984 249 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 MGMTP16455 207 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP1B3P54709 279 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM50BP56557 158 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR56B2PQ8NGI1 322 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5L1Q8NGL2 311 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIGCQ92535 297 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 ST6GAL2Q96JF0 529 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 C20orf85Q9H1P6 137 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM215AQ9Y5M1 114 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 FIGNL2A6NMB9 653 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD74P04233 296 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 RCVRNP35243 200 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D28Q2M2D7 210 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 MOB3CQ70IA8 216 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q8NA96 180 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 PXT1Q8NFP0 134 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB3CQ96E17 227 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 GHITMQ9H3K2 345 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 PROCRQ9UNN8 238 aa24.52■■□□□ 1.52
CTDNEP1-210ENST00000574322 TOXO94900 526 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFB6O95139 128 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-210ENST00000574322 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-210ENST00000574322 TIMP3P35625 211 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB25P57735 213 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLAC9Q5JTB6 97 aa24.51■■□□□ 1.51
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1orf185Q5T7R7 199 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms