RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568569.1

GTF3C1-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-209ENST00000568569 SMIM11AP58511 58 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 KRTAP10-11P60412 298 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 CD83Q01151 205 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 PRDX4Q13162 271 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 PLA1AQ53H76 456 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 FAM57BQ71RH2 274 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 TMEM219Q86XT9 240 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 OR52L1Q8NGH7 329 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 C7orf34Q96L11 122 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 OR10A2Q9H208 303 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 RGCCQ9H4X1 137 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 C19orf12Q9NSK7 152 aa9.52□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 DHRS12A0PJE2 317 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 A6NDX4 124 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF850A8MQ14 1090 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 GADD45GO95257 159 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 PSG2P11465 335 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 NCK1P16333 377 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 FMO3P31513 532 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 DCTDP32321 178 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 GSSP48637 474 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 RAB13P51153 203 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 CAPZA1P52907 286 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ERVFRD-1P60508 538 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 TEX30Q5JUR7 227 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 HPSE2Q8WWQ2 592 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 SDSLQ96GA7 329 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 RNF170Q96K19 258 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 USE1Q9NZ43 259 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF222Q9UK12 451 aa9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 NDUFAB1O14561 156 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 CLIC3O95833 236 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 CST4P01036 141 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 SLC25A1P53007 311 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 TSPAN31Q12999 210 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 Q6ZS46 218 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 TIGD4Q8IY51 512 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF511Q8NB15 262 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 OR6K6Q8NGW6 343 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 DPF1Q92782 380 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 MALSU1Q96EH3 234 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 PGAM5Q96HS1 289 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 MUC13Q9H3R2 512 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 CDH10Q9Y6N8 788 aa9.5□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 F2RL2O00254 374 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 SLC22A2O15244 555 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 SYNGR1O43759 233 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 RHBDL1O75783 438 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ARG1P05089 322 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 GYPBP06028 91 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 CCL3L1P16619 93 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ACKR3P25106 362 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 GPM6AP51674 278 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 BLVRAP53004 296 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 BLCAPP62952 87 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 SSX2Q16385 188 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 RNF133Q8WVZ7 376 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 PIGCQ92535 297 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 YY1AP1Q9H869 796 aa9.49□□□□□ -0.89
GTF3C1-209ENST00000568569 BRD7Q9NPI1 651 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms