RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP1B3P54709 279 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCAND1P57086 179 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RIN1Q13671 783 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL18Q14116 193 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMTM3Q96MX0 182 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ING4Q9UNL4 249 aa14.77□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 DPRXA6NFQ7 191 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 WIPF3A6NGB9 483 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCD4O14678 606 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAPZA1P52907 286 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 BSPH1Q075Z2 132 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A25Q6T423 547 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 BORCS5Q969J3 196 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.76□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLATP00750 562 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLRXP35754 106 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTGFRP43088 359 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP5CP53041 499 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLA2G7Q13093 441 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10K2Q6IF99 312 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 C16orf87Q6PH81 154 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR8S1Q8NH09 359 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF170Q96K19 258 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 DUSP13Q9UII6 198 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 V9GYH0 126 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CADP27708 2225 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 BPNT1O95861 308 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM225BP0DP42 221 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLA2G2AP14555 144 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD40LGP29965 261 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIR2DL3P43628 341 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPM6AP51674 278 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PYDC2Q56P42 97 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHF21AQ96BD5 680 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAL3ST1Q99999 423 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.75□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF732B4DXR9 585 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 J3QKU1 62 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MMP15P51511 669 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFNB2P52799 333 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 BEX5Q5H9J7 111 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT74Q7RTS7 529 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR8G5Q8NG78 346 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5A2Q8NGI9 324 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM46BQ96A09 425 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCG5Q9H222 651 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.74□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 KITLGP21583 273 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITPKCQ96DU7 683 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM100Q9NV29 134 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBBP0CG47 229 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 VSIG8P0DPA2 414 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 PITPNBP48739 271 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR8G1Q15617 311 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF79Q15937 498 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRP11Q86VZ4 500 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB22AQ9UL26 194 aa14.73□□□□□ -0.05
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms