RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 NYAP2Q9P242 653 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 DUX4Q9UBX2 424 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 AGLP35573 1532 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TOPBP1Q92547 1522 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 IFT172Q9UG01 1749 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 DISP2A7MBM2 1401 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CRB1P82279 1406 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 C10orf71Q711Q0 1435 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa3.01□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 UGGT1Q9NYU2 1555 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 NFASCO94856 1347 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ABCC1P33527 1531 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 MYH7P12883 1935 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 A0A0J9YYE9 177 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 J3QRK9 145 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 RGS5O15539 181 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 UPK1BO75841 260 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CD160O95971 181 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 MOSP00540 346 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 IFNA7P01567 189 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TRBC1P01850 177 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PSKH1P11801 424 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 IL7P13232 177 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 UGT2B10P36537 528 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CTRLP40313 264 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 HTR2BP41595 481 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 GPR1P46091 355 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CYB561P49447 251 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 AQP5P55064 265 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 RAB4BP61018 213 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 GNB2P62879 340 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 GNA12Q03113 381 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 MXD1Q05195 221 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 REG3AQ06141 175 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 STX5Q13190 355 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 UNC119Q13432 240 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 EXOC3L4Q17RC7 722 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PTPN20Q4JDL3 420 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF493Q6ZR52 646 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CMTM8Q8IZV2 173 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 RNF175Q8N4F7 328 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 LINC01555Q8NAE3 123 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TMEM104Q8NE00 496 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TCP10LQ8TDR4 215 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 MITD1Q8WV92 249 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 APH1BQ8WW43 257 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TMIGD2Q96BF3 282 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PDXPQ96GD0 296 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 GLT1D1Q96MS3 346 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PDCD10Q9BUL8 212 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ING2Q9H160 280 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 LINC00597Q9H2U6 94 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TMEM38AQ9H6F2 299 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ASB8Q9H765 288 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 UCK1Q9HA47 277 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PDFQ9HBH1 243 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 IFT46Q9NQC8 304 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 MCUBQ9NWR8 336 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CLN6Q9NWW5 311 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 GLTPQ9NZD2 209 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 CD84Q9UIB8 345 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ASB4Q9Y574 426 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 BCL9LQ86UU0 1499 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF609O15014 1411 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 VWDEQ8N2E2 1590 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 NID2Q14112 1375 aa3□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 MYH13Q9UKX3 1938 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ARHGAP5Q13017 1502 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 TSPOAP1O95153 1857 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 A0A1W2PPV4 95 aa2.99□□□□□ -1.93
PRPF39-210ENST00000556718 A0A1W2PQ67 120 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms