RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SPTSSA	Q969W0	71 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LGALS12	Q96DT0	336 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	WDFY2	Q96P53	400 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SLC22A4	Q9H015	551 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	VCX	Q9H320	206 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	C16orf95	Q9H693	158 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TMEM100	Q9NV29	134 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CLN6	Q9NWW5	311 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LRP12	Q9Y561	859 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		5.68	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	BTBD17	A6NE02	478 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SLC16A6	O15403	523 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	XPNPEP2	O43895	674 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GPR137B	O60478	399 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FAM20B	O75063	409 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TSPAN9	O75954	239 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	IGHV1-69	P01742	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MMP9	P14780	707 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ALOX5AP	P20292	161 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TGFBR2	P37173	567 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OPRL1	P41146	370 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	BLVRA	P53004	296 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TPTE	P56180	551 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF85	Q03923	595 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PCK2	Q16822	640 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TEX30	Q5JUR7	227 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	COMMD2	Q86X83	199 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SGCD	Q92629	289 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PGAM5	Q96HS1	289 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CNBD2	Q96M20	576 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RDH12	Q96NR8	316 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OR8B4	Q96RC9	309 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TBX15	Q96SF7	602 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	KCNJ15	Q99712	375 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GNG8	Q9UK08	70 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		5.67	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GVI7	797 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	DAPL1	A0PJW8	107 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		A6NIN4	97 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	C22orf46	C9J442	243 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		F5H5P2	479 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		H0YL77	283 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		J3QLW9	94 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TSPAN15	O95858	294 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	IGHV4-59	P01825	116 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OPN1MW	P04001	364 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HLA-DPB1	P04440	258 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	SFTPB	P07988	381 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF19	P17023	458 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PMEL	P40967	661 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	CD200	P41217	278 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ISL1	P61371	349 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	ZNF92	Q03936	586 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	MAB21L1	Q13394	359 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TIGD6	Q17RP2	521 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	TTC23	Q5W5X9	447 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	C11orf88	Q6PI97	169 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		5.66	□□□□□ -1.5
CS-233	ENST00000552688		Q6ZSV7	163 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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