RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	FTMT	Q8N4E7	242 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2T33	Q8NG76	320 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SP140L	Q9H930	580 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	VNN3	Q9NY84	501 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	NLK	Q9UBE8	527 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF222	Q9UK12	451 aa		10.23	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931		H0YAE9	185 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNB2	O95067	398 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CST4	P01036	141 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GLRA1	P23415	457 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	POU1F1	P28069	291 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GABRA2	P47869	451 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	BLVRA	P53004	296 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	BLMH	Q13867	455 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TIGD4	Q8IY51	512 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00471	Q8N535	108 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PIGC	Q92535	297 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF170	Q96K19	258 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CDRT15	Q96T59	188 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RGCC	Q9H4X1	137 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	IFNG	P01579	166 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	H2BFM	P0C1H6	154 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PSG2	P11465	335 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF3	P17036	446 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP6V1B2	P21281	511 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GSTT1	P30711	240 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEA2	P43356	314 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	GPM6A	P51674	278 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	SNCB	Q16143	134 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MKX	Q8IYA7	352 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	PIFO	Q8TCI5	191 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	OTULIN	Q96BN8	352 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCB9	Q9NP78	766 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931		U3KQV3	271 aa		10.21	□□□□□ -0.77
LETMD1-231	ENST00000551931	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	SELENOF	O60613	162 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	GLCE	O94923	617 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	BMX	P51813	675 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	AANAT	Q16613	207 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP78	Q5JTW2	689 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	SHF	Q7M4L6	423 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	MRAP	Q8TCY5	172 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	SDSL	Q96GA7	329 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	OR51I2	Q9H344	312 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	YY1AP1	Q9H869	796 aa		10.2	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF732	B4DXR9	585 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	LYN	P07948	512 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	CD28	P10747	220 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	MICA	Q29983	383 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	OTOS	Q8NHW6	89 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	THEM6	Q8WUY1	208 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		10.19	□□□□□ -0.78
LETMD1-231	ENST00000551931	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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