RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 HRASLSQ9HDD0 168 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf67A6NJJ6 358 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 H7C417 338 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 M0R129 80 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SNCGO76070 127 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RAB40ALP0C0E4 278 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HBA1P69905 142 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE5Q13069 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GAGE6Q13070 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 THEM6Q8WUY1 208 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BAQ96A08 127 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ISL2Q96A47 359 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHA2Q9HB19 425 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LPAR2Q9HBW0 351 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RASD1Q9Y272 281 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 V9GYY9 64 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TAF1P21675 1872 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 A6NNC1 897 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 B4DEV8 164 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PPBPP02775 128 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TYMSP04818 313 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NMBP08949 121 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FOXL2P58012 376 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RAC3P60763 192 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CTF1Q16619 201 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 WDFY1Q8IWB7 410 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR5W2Q8NH69 310 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NEIL2Q969S2 332 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SAMD8Q96LT4 415 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DUX5Q96PT3 197 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TSSK6Q9BXA6 273 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LPAR5Q9H1C0 372 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 S1PR5Q9H228 398 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PSMB11A5LHX3 300 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 P2RX6O15547 441 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ACTL6BO94805 426 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ARFRP1Q13795 201 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FZD2Q14332 565 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MPEG1Q2M385 716 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF774Q6NX45 483 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP18Q8NEJ0 188 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ST8SIA1Q92185 356 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 APIPQ96GX9 242 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ACY3Q96HD9 319 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GINS3Q9BRX5 216 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 C5AR2Q9P296 337 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FBXL17Q9UF56 701 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 EDNRAP25101 427 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SFTPDP35247 375 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SLC19A1P41440 591 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TNFSF10P50591 281 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GPM6AP51674 278 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF266Q14584 549 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 UNC50Q53HI1 259 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GATSQ8NAP1 163 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR5A1Q8NGJ0 315 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NT5CQ8TCD5 201 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GNRHR2Q96P88 292 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A8Q9BY19 250 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CST9LQ9H4G1 147 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 AUNIPQ9H7T9 357 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TVP23BQ9NYZ1 205 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PPIL1Q9Y3C6 166 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CRYAAP02489 173 aa5.66□□□□□ -1.5
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