RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	AZU1	P20160	251 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	FUT3	P21217	361 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	HRH1	P35367	487 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TDGF1P3	P51864	188 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	RND2	P52198	227 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K7CL	P57077	242 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MXD1	Q05195	221 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CLINT1	Q14677	625 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SGCA	Q16586	387 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GUCA2B	Q16661	112 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZSR6	202 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	LMX1A	Q8TE12	382 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	P2RX4	Q99571	388 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SH3GL3	Q99963	347 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DDA1	Q9BW61	102 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	F8	P00451	2351 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GUH1	482 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PRD5	423 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ERICH4	A6NGS2	130 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	LYRM9	A8MSI8	78 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	HDAC3	O15379	428 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC31A1	O15431	190 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SPOP	O43791	374 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ICOSLG	O75144	302 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	FKBP6	O75344	327 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT34	O76011	436 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TNF	P01375	233 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MB	P02144	154 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	HPN	P05981	417 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	STAG3L2	P0CL84	134 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	HTR1E	P28566	365 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	BMI1	P35226	326 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CTRL	P40313	264 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CCL7	P80098	99 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	XIAP	P98170	497 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TMED1	Q13445	227 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	NCF4	Q15080	339 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GABRA6	Q16445	453 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	IL17A	Q16552	155 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	RPEL1	Q2QD12	228 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR107	Q5VW38	600 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM215	Q68D42	235 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GUSBP11	Q6P575	273 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	HORMAD1	Q86X24	394 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	NPB	Q8NG41	125 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB1C	Q92928	201 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf76	Q96K31	380 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	C9orf72	Q96LT7	481 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEB18	Q96M61	343 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PIGU	Q9H490	435 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	IL17C	Q9P0M4	197 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		2.84	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	HIVEP1	P15822	2718 aa		2.84	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0B4J2A0	478 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	GJE1	A6NN92	205 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	C10orf142	B7Z368	130 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308		D6RAR5	112 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	EMC8	O43402	210 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	RAD1	O60671	282 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SNHG1-222	ENST00000545308	AQP8	O94778	261 aa		2.83	□□□□□ -1.96

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