RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 KAAG1Q9UBP8 84 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 CDIPTO14735 213 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 WNT9BO14905 357 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT7O43581 403 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 TOX4O94842 621 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 BAG2O95816 211 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ALPLP05186 524 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 CRYBA1P05813 215 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 HTR1AP08908 422 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF20P17024 532 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 MYL12AP19105 171 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKACBP22694 351 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 GLRA1P23415 457 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 RANBP1P43487 201 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 GPM6AP51674 278 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 HILS1P60008 231 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 IL13RA1P78552 427 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PAX8Q06710 450 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB40BQ12829 278 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OCLNQ16625 522 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX36Q5VZQ5 186 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 NCR3LG1Q68D85 454 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 LYPD4Q6UWN0 246 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.69□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 ENTHD1Q8IYW4 607 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ELMOD2Q8IZ81 293 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ACBD7Q8N6N7 88 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB108BQ8NET1 73 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OR8B12Q8NGG6 310 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.69□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ST8SIA4Q92187 359 aa4.69□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 C19orf24Q9BVV8 132 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 TLNRD1Q9H1K6 362 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 VCX3BQ9H321 246 aa4.69□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 RHOFQ9HBH0 211 aa4.69□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 GPR84Q9NQS5 396 aa4.69□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM206AQ9NX38 181 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 GNG8Q9UK08 70 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 OR52A1Q9UKL2 312 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa4.69□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 RYR3Q15413 4870 aa4.69□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa4.68□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 FUOMA2VDF0 154 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC182A6NF36 153 aa4.68□□□□□ -1.66
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CLSTN3-215ENST00000544584 ERICH4A6NGS2 130 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 SRRM5B3KS81 715 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF879B4DU55 563 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF732B4DXR9 585 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 J3QT63 122 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 EI24O14681 340 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 NXPH2O95156 264 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PAHP00439 452 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 LHBP01229 141 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 GYPAP02724 150 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 CD2P06729 351 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC159P0C7I6 412 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 DCKP27707 260 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMB10P40306 273 aa4.68□□□□□ -1.66
CLSTN3-215ENST00000544584 HAAOP46952 286 aa4.68□□□□□ -1.66
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