RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 FUNDC2Q9BWH2 189 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 MIXL1Q9H2W2 232 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 DSN1Q9H410 356 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 ANKRD19PQ9H560 264 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 NIT2Q9NQR4 276 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 SPANXCQ9NY87 97 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 KLRF1Q9NZS2 232 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 COPZ2Q9P299 210 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 ZNF221Q9UK13 617 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 FBXO5Q9UKT4 447 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 BCL9O00512 1426 aa2.64□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 ARL5CA6NH57 179 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 OR7A17O14581 309 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 CRXO43186 299 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 CHST10O43529 356 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 PDE6DO43924 150 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 ENTPD6O75354 484 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 IFNA1P01562 189 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 RLN2P04090 185 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 P04436 131 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 WNT2P09544 360 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 SLC35G4P0C7Q5 338 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 P0C879 139 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 FOXN2P32314 431 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 AKR1C3P42330 323 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 SULT1A1P50225 295 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 SULT1A2P50226 295 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 TAS2R41P59536 307 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 OR1C1Q15619 314 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 TRAM1Q15629 374 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 PRSS8Q16651 343 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 CDKN3Q16667 212 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 FBXW9Q5XUX1 488 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 FAM71E1Q6IPT2 247 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 PLET1Q6UQ28 207 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM205Q6UW68 189 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 OR10G3Q8NGC4 313 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 OR52I1Q8NGK6 324 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 OR6M1Q8NGM8 313 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 OR1K1Q8NGR3 316 aa2.63□□□□□ -1.99
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PTPRK-220ENST00000531466 OR6F1Q8NGZ6 308 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 GHSRQ92847 366 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 UCN3Q969E3 161 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 C14orf144Q96I85 54 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 C12orf42Q96LP6 360 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 BIRC8Q96P09 236 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 RCHY1Q96PM5 261 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRK-220ENST00000531466 FMO2Q99518 471 aa2.63□□□□□ -1.99
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