RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC00518Q8N0U6 118 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-221ENST00000511747 SPSB2Q99619 263 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-221ENST00000511747 MYO7BQ6PIF6 2116 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINE3A8MV23 424 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 IGLV3-1P01715 115 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 S100A10P60903 97 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 LSM6P62312 80 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DTX1Q86Y01 620 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PMS2P1A4D2B8 440 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SFTPBP07988 381 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 FAHP16930 419 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF1P41567 113 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PRAMEF20Q5VT98 475 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 LCN10Q6JVE6 187 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SEC11CQ9BY50 192 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ACKR4Q9NPB9 350 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 FCGR2AP12318 317 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ADH6P28332 368 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC35A1P78382 337 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXRED2Q8IWF2 684 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 GJC3Q8NFK1 279 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DNASE2BQ8WZ79 361 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 S100A13Q99584 98 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DEFB126Q9BYW3 111 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MLXQ9UH92 298 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ADAMTS20P59510 1910 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DHRS3O75911 302 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MSR1P21757 451 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SMIM8Q96KF7 97 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF175Q9Y473 711 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SNAPINO95295 136 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC16A14Q7RTX9 510 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TDHQ8IZJ6 230 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 FADS6Q8N9I5 356 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RHOFQ9HBH0 211 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TAF9BQ9HBM6 251 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RARRES3Q9UL19 164 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM96BQ9Y3D0 163 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0U1RQV5 110 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DKK1O94907 266 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 THBS4P35443 961 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC18Q8N456 261 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 NELFAQ9H3P2 528 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5H15A6NDH6 313 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 LRP3O75074 770 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PHYHD1Q5SRE7 291 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 C6orf201Q7Z4U5 140 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TM2D1Q9BX74 207 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PIGLQ9Y2B2 252 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MEMO1Q9Y316 297 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 V9GYS6 101 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 IFNA2P01563 188 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CPT2P23786 658 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CSNK1A1P48729 337 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 H3F3AP84243 136 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PP6455Q8WZ26 134 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 HAS2Q92819 552 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CHST5Q9GZS9 411 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 HKR1P10072 659 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PTGER4P35408 488 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 NPBWR1P48145 328 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CAV2P51636 162 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SHBQ15464 509 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PIGTQ969N2 578 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf123Q9NWV4 160 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DHRS7CA6NNS2 312 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TAAR5O14804 337 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SHDQ96IW2 340 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 NR2C1P13056 603 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ARL6IP1Q15041 203 aa23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms