RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	RORB	Q92753	470 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF747	Q9BV97	191 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	VCX3B	Q9H321	246 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	AMBN	Q9NP70	447 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		13.87	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	FAM20B	O75063	409 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	IGHA1	P01876	353 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PAX2	Q02962	417 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PRDX4	Q13162	271 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	KLHL22	Q53GT1	634 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ITPKC	Q96DU7	683 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MICU1	Q9BPX6	476 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.86	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148		A6NLC8	198 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	FSTL3	O95633	263 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PRTN3	P24158	256 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	FPR2	P25090	351 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	GALE	Q14376	348 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MPPED2	Q15777	294 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PIGC	Q92535	297 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		13.85	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148		A0A1B0GVI7	797 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM210	A6NLX4	147 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148		H0YJX3	145 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	P2RY10	O00398	339 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF205	O95201	554 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	GRP	P07492	148 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CCL1	P22362	96 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CD80	P33681	288 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	OR12D2	P58182	307 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PAX8	Q06710	450 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	KRT74	Q7RTS7	529 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	SYS1	Q8N2H4	156 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	JAM3	Q9BX67	310 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	RNF7	Q9UBF6	113 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148		V9GYS6	101 aa		13.84	□□□□□ -0.19
MIB2-223	ENST00000508148	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	SYT7	O43581	403 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	HTR1A	P08908	422 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	GNAO1	P09471	354 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	WNT2	P09544	360 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	FAH	P16930	419 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	PSMB10	P40306	273 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	PMEL	P40967	661 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	AQP4	P55087	323 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZSR3	168 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	WDR86	Q86TI4	376 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	TFAP2C	Q92754	450 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.83	□□□□□ -0.2
MIB2-223	ENST00000508148	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2

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