RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SMLR1H3BR10 107 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 MFNGO00587 321 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SOCS1O15524 211 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 FABP7O15540 132 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 FCGR2AP12318 317 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ANXA3P12429 323 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GNB3P16520 340 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR8B8Q15620 311 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 CLVS2Q5SYC1 327 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF626Q68DY1 528 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 MCEMP1Q8IX19 187 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 OR8S1Q8NH09 359 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 EXTL1Q92935 676 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GPER1Q99527 375 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GINS4Q9BRT9 223 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM59Q9BXS4 323 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 BANF2Q9H503 90 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR173Q9NS66 373 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC2A8Q9NY64 477 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ING4Q9UNL4 249 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A20A6NK97 555 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 M0QYG6 137 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 EFSO43281 561 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 XRCC2O43543 280 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 CA11O75493 328 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 RAD51DO75771 328 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 HLA-HP01893 362 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 FCER2P06734 321 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 AGTR1P30556 359 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ARR3P36575 388 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 OR3A2P47893 321 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 MEF2DQ14814 521 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.911e-9■■■■■ 28.8
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SH3BP2-209ENST00000504450 NLRC3Q7RTR2 1065 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.35□□□□□ -0.91
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SH3BP2-209ENST00000504450 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.35□□□□□ -0.91
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SH3BP2-209ENST00000504450 RAB3CQ96E17 227 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 HYLS1Q96M11 299 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC6A7Q99884 636 aa9.35□□□□□ -0.91
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SH3BP2-209ENST00000504450 CST11Q9H112 138 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
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SH3BP2-209ENST00000504450 UPB1Q9UBR1 384 aa9.35□□□□□ -0.91
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR2A4O95047 310 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 IL18BPO95998 194 aa9.34□□□□□ -0.91
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SH3BP2-209ENST00000504450 MGMTP16455 207 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 TBPP20226 339 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 MPGP29372 298 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 ZMYND11Q15326 602 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 GUSBP1Q15486 140 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.34□□□□□ -0.91
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXW9Q5XUX1 488 aa9.34□□□□□ -0.91
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