RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 K7N7A8 449 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SLC16A5O15375 505 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SLC25A17O43808 307 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SEMA4FO95754 770 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 IGSF6O95976 241 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MBPP02686 304 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PFN1P07737 140 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CYC1P08574 325 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 IL9P15248 144 aa3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PYCR1P32322 319 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ACVR1BP36896 505 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MPLP40238 635 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CTRLP40313 264 aa3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 P2RY1P47900 373 aa3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 CAMLGP49069 296 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 OR12D2P58182 307 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PMS2P11Q13670 270 aa3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 C1orf189Q5VU69 101 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PRR27Q6MZM9 219 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 NXPE4Q6UWF7 544 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 HFE2Q6ZVN8 426 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PIANPQ8IYJ0 282 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CLDN19Q8N6F1 224 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 STPG4Q8N801 248 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 PELI1Q96FA3 418 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 C2orf50Q96LR7 162 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 SLC6A7Q99884 636 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 GABRG3Q99928 467 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 LRFN3Q9BTN0 628 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 HDAC8Q9BY41 377 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 OR11A1Q9GZK7 315 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CST11Q9H112 138 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CXCL16Q9H2A7 254 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.12□□□□□ -1.91
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PCAT4-201ENST00000504263 BET1LQ9NYM9 111 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 RAB22AQ9UL26 194 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 CYP8B1Q9UNU6 501 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 VSIG4Q9Y279 399 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 WIPI2Q9Y4P8 454 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 LRP12Q9Y561 859 aa3.12□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ANKUB1A6NFN9 424 aa3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ARL5CA6NH57 179 aa3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 VSTM2BA6NLU5 285 aa3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 FAM166BA8MTA8 275 aa3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 HIDE1A8MVS5 230 aa3.11□□□□□ -1.91
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
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