RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 UFD1Q92890 307 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 HPS1Q92902 700 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ITFG2Q969R8 447 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 GCM1Q9NP62 436 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 LRCH1Q9Y2L9 728 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF281Q9Y2X9 895 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 VPS13CQ709C8 3753 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF732B4DXR9 585 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 H7C1Q1 480 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 NDUFS8O00217 210 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 OGG1O15527 345 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CHN2P52757 468 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 GMFBP60983 142 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 MAB21L1Q13394 359 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 IRF3Q14653 427 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 MPPED2Q15777 294 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 PP6455Q8WZ26 134 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB1CQ92928 201 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ITPKCQ96DU7 683 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TMED9Q9BVK6 235 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC42Q9Y546 428 aa11.32□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5B21A6NL26 309 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM210A6NLX4 147 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF205O95201 554 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFAIP8O95379 198 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 PLATP00750 562 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A16P16260 332 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMB9P28065 219 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 THBS2P35442 1172 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 GNG3P63215 75 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF773Q6PK81 442 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF826PQ6ZT77 177 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF367Q7RTV3 350 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf87Q8N0U7 546 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 C10orf35Q96D05 121 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 REG4Q9BYZ8 158 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CHST5Q9GZS9 411 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 NEK6Q9HC98 313 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 DCAF16Q9NXF7 216 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CKLFQ9UBR5 152 aa11.31□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GWJ7 208 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 IFNL4K9M1U5 179 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 CDIPTO14735 213 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 RP2O75695 350 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 HCKP08631 526 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 NR4A2P43354 598 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM33P57088 247 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP3R1P63098 170 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 BDH1Q02338 343 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF154Q13106 437 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 NEDD8Q15843 81 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 YIF1BQ5BJH7 314 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR86Q86TI4 376 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 SPARTQ8N0X7 666 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRC29Q8WV35 223 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM203Q969S6 136 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ERGIC1Q969X5 290 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM106AQ96A25 262 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 BORCS8Q96FH0 119 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 TECTBQ96PL2 329 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 OR14A2Q96R54 314 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 MGLLQ99685 303 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 GAL3ST1Q99999 423 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 ACOT13Q9NPJ3 140 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF7Q9UBF6 113 aa11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1W2PPK0 400 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 LRP5LA4QPB2 252 aa11.29□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGEB3O15480 346 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms