RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 V9GYH0 126 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIOO75962 3097 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 OR7A17O14581 309 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM253P0C7T8 217 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB25P24278 435 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 GLYATQ6IB77 296 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 RHBDD2Q6NTF9 364 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 TEX38Q6PEX7 206 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GLCTQ6Y288 498 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 ISM1B1AKI9 464 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 RS1O15537 224 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 AIREO43918 545 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 LRATO95237 230 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 HTR2CP28335 458 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SRD5A2P31213 254 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF84P51523 738 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 CLDN12P56749 244 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ST3GAL3Q11203 375 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINA11Q86U17 422 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 D2HGDHQ8N465 521 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 M1APQ8TC57 530 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 OR10H1Q9Y4A9 318 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 COX11Q9Y6N1 276 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-213ENST00000496055 DLL4Q9NR61 685 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ASF1AQ9Y294 204 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-213ENST00000496055 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 A1L4Q6 167 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.776e-7■■■■□ 24
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN15O95858 294 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 GCGP01275 180 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 RLN1P04808 185 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5G3P0C626 314 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM157BP0CG42 384 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-213ENST00000496055 COX6B1P14854 86 aa4.02□□□□□ -1.77
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