RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 PLEK2Q9NYT0 353 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 TRAPPC6AO75865 159 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 AKR1C4P17516 323 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 AVPR2P30518 371 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 HFEQ30201 348 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 NANPQ8TBE9 248 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 MAFIPQ8WZ33 124 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PIGTQ969N2 578 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PRRT1Q99946 306 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PIGQQ9BRB3 760 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 COMMD9Q9P000 198 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 LOXL2Q9Y4K0 774 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PINLYPA6NC86 204 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 STMND1H3BQB6 276 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 P04436 131 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 SPP1P10451 314 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ZBTB25P24278 435 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 NFYBP25208 207 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CTSSP25774 331 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 KISS1Q15726 138 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 MICBQ29980 383 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 DCAF12Q5T6F0 453 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 OR4K15Q8NH41 348 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CXCL13O43927 109 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 VAMP5O95183 116 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 MGMTP16455 207 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 AGTR1P30556 359 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 FGL1Q08830 312 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 OR2AE1Q8NHA4 323 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 GLS2Q9UI32 602 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.26□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 LRRC3CA6NJW4 275 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 F8W036 122 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 IFNA6P05013 189 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 VAMP1P23763 118 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CARD18P57730 90 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 FAM209BQ5JX69 171 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 OR51T1Q8NGJ9 327 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CRLF2Q9HC73 371 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 EDARQ9UNE0 448 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 C9orf170A2RU37 121 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 M0R135 149 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 EFSO43281 561 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 IGLV3-1P01715 115 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CHRM2P08172 466 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 FCGR2AP12318 317 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PI3P19957 117 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 RFC3P40938 356 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 AKR1C3P42330 323 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 PTGFRP43088 359 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ATP1B3P54709 279 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CLDN15P56746 228 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 HIST1H3AP68431 136 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 HGFACQ04756 655 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ACER2Q5QJU3 275 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ZNF774Q6NX45 483 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 KCTD9Q7L273 389 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 OR2W3Q7Z3T1 314 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 LYG2Q86SG7 212 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 GGNQ86UU5 652 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 SGK3Q96BR1 496 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ZNF799Q96GE5 643 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 SGCZQ96LD1 299 aa11.25□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 192.2 ms