RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 ZNF573Q86YE8 665 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 GALNT14Q96FL9 552 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZNF607Q96SK3 696 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MICU1Q9BPX6 476 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.77□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SIAH2O43255 324 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NME2P1O60361 137 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SLC2A10O95528 541 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 BRS3P32247 399 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CD80P33681 288 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SULT1A1P50225 295 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RPTNQ6XPR3 784 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 C4orf36Q96KX1 117 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 UBQLN4Q9NRR5 601 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 M0R143 59 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BKO60814 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NEURL1O76050 574 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BJP06899 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CT62P0C5K7 136 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CALCBP10092 127 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TUBG1P23258 451 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BOP23527 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BBP33778 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BDP58876 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BCP62807 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ZNF529Q6P280 563 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 BTNL8Q6UX41 500 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 S100A7AQ86SG5 101 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.77□□□□□ -1.33
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USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TSLPQ969D9 159 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 MIB2Q96AX9 1013 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NEURL3Q96EH8 262 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CALML5Q9NZT1 146 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CNIH4Q9P003 139 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 UPB1Q9UBR1 384 aa6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR5H15A6NDH6 313 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR5H1A6NKK0 313 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 IGHG3P01860 377 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 KLK1P06870 262 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CHRM4P08173 479 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 AKAIN1P0CW23 69 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SSR2P43308 183 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 PPICP45877 212 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SLC6A9P48067 706 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SELENOTP62341 195 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 RAB1AP62820 205 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 C1orf189Q5VU69 101 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GALNT16Q8N428 558 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 FADS6Q8N9I5 356 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 NINJ1Q92982 152 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ADGRG7Q96K78 797 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 SYT4Q9H2B2 425 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.76□□□□□ -1.33
USP4-211ENST00000485450 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
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