RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	LCN2	P80188	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	NAAA	Q02083	359 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR4D1	Q15615	310 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RDH5	Q92781	318 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	APH1A	Q96BI3	265 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZIM3	Q96PE6	472 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	GPA33	Q99795	319 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SP140L	Q9H930	580 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	NRN1	Q9NPD7	142 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MMP26	Q9NRE1	261 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912		F8WDY8	70 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912		H0YIV9	168 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CFLAR	O15519	480 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SEMA3D	O95025	777 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PSMG1	O95456	288 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	H6PD	O95479	791 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PGAM1	P18669	254 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM33	P57088	247 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TAS2R39	P59534	338 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PRPS1	P60891	318 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF117	Q03924	483 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CD226	Q15762	336 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CBLN3	Q6UW01	205 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	C4orf22	Q6V702	233 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PEX26	Q7Z412	305 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FBXO30	Q8TB52	745 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MCHR2	Q969V1	340 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CERS2	Q96G23	380 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CYYR1	Q96J86	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	LCE6A	A0A183	80 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	GJE1	A6NN92	205 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912		K7EPI3	171 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	LGALS8	O00214	317 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	UPK1A	O00322	258 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	LANCL1	O43813	399 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF253	O75346	499 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	GSTA1	P08263	222 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	UCP1	P25874	307 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF154	Q13106	437 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	SELENBP1	Q13228	472 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	PDK3	Q15120	406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	CASC10	Q5T4H9	136 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM107	Q6UX40	140 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	LRP11	Q86VZ4	500 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	TEX9	Q8N6V9	391 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		3.36	□□□□□ -1.87

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