RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV12-3P01733 135 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT7P08729 469 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TCN2P20062 427 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DMAP28067 261 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEA2P43356 314 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 IFITM3Q01628 133 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 BNIP2Q12982 314 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ERCC8Q13216 396 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 IRF4Q15306 451 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 IL17AQ16552 155 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 HHATQ5VTY9 493 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf120Q7Z4R8 191 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR13G1Q8NGZ3 307 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM17AQ99595 171 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM243Q9BU79 118 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 C9J4A7 227 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 LAD1O00515 517 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PHOX2AO14813 284 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PSPHP1O15172 72 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 UBDO15205 165 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 HDAC3O15379 428 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 MPZL1O95297 269 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT1P36639 197 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2AP49459 152 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 VEGFCP49767 419 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PPOXP50336 477 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CRISP3P54108 245 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB8AP61006 207 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ARG2P78540 354 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP24A1Q07973 514 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 MADCAM1Q13477 382 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf99Q4VX62 202 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ACBD4Q8NC06 268 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4K2Q8NGD2 314 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CDS1Q92903 461 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM159Q96B96 161 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TM4SF18Q96CE8 201 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SMARCD1Q96GM5 515 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35E1Q96K37 410 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TAAR1Q96RJ0 339 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFRSF19Q9NS68 423 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 USE1Q9NZ43 259 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 C2orf16Q68DN1 1984 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DEXIO95424 95 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A27O95847 323 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 BCHEP06276 602 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF35P13682 527 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB5P28074 263 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 APLNRP35414 380 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB2P49721 201 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF136P52737 540 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 STC1P52823 247 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 NAB1Q13506 487 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SHHQ15465 462 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A30Q5SVS4 291 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OTPQ5XKR4 325 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 AP1ARQ63HQ0 302 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT2A3Q6UWM9 527 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PAGE2Q7Z2X7 111 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DCXRQ7Z4W1 244 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8J2Q8NGG1 315 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 NELFBQ8WX92 580 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM158Q8WZ71 300 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 MRAP2Q96G30 205 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNS1Q96KK3 526 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RILPQ96NA2 401 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM210AQ96ND0 272 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2M4Q96R27 311 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 APOL4Q9BPW4 351 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SFXN3Q9BWM7 321 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 LHX5Q9H2C1 402 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB22AQ9UL26 194 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCA7Q8IZY2 2146 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PRG6 482 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC31A1O15431 190 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-209ENST00000473406 FGF16O43320 207 aa4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms