RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	CPT2	P23786	658 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NPY4R	P50391	375 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	GNG3	P63215	75 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	IKZF1	Q13422	519 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	CD276	Q5ZPR3	534 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	MBOAT4	Q96T53	435 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NUP50	Q9UKX7	468 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DVL1	O14640	695 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SYT7	O43581	403 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	VENTX	O95231	258 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	GLRA1	P23415	457 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	GABRA2	P47869	451 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ACTG1	P63261	375 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TMED1	Q13445	227 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	WDR38	Q5JTN6	314 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DOK3	Q7L591	496 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	JMJD8	Q96S16	334 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SLC29A1	Q99808	456 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OR5B21	A6NL26	309 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	C22orf46	C9J442	243 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFB3	O43676	98 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	RHBDL1	O75783	438 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	LHB	P01229	141 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TFF1	P04155	84 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	FGF12	P61328	243 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ACTC1	P68032	377 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ACTA1	P68133	377 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	PAX8	Q06710	450 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZSCAN26	Q16670	478 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	BATF2	Q8N1L9	274 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	RORB	Q92753	470 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF69	Q9UC07	566 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0A6YYJ9	748 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GW55	424 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SRRM5	B3KS81	715 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM77	I1YAP6	450 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880		J3QLW9	94 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SULT1C4	O75897	302 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF19	P17023	458 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	HAAO	P46952	286 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	CAPZA1	P52907	286 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF85	Q03923	595 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OCLN	Q16625	522 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	FGFRL1	Q8N441	504 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880		Q96MT0	163 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX5	Q96PT3	197 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	AMBN	Q9NP70	447 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DUX4	Q9UBX2	424 aa		12.3	□□□□□ -0.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms