RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	TFPT	P0C1Z6	253 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CXCL8	P10145	99 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	PMCH	P20382	165 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR1	P46091	355 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	GPNMB	Q14956	572 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A0G2JLM5	398 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A1B0GVI7	797 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	ISPD	A4D126	451 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CENPX	A8MT69	81 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378		A8MUA0	341 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CENPBD1	B2RD01	187 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378		J3QRK9	145 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC22A1	O15245	554 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	XRCC2	O43543	280 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	DPM1	O60762	260 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	SCEL	O95171	688 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	AIFM1	O95831	613 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CGA	P01215	116 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	APOA1	P02647	267 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	GFAP	P14136	432 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	OR1E1	P30953	314 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	BTC	P35070	178 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	HCAR3	P49019	387 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFA1	P59665	94 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFA3	P59666	94 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	TPI1	P60174	286 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	LCN2	P80188	198 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	STK11	Q15831	433 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	OAF	Q86UD1	273 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	MSANTD3	Q96H12	275 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
RBBP4-208	ENST00000463378	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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