RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	NMES1	Q9C002	83 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ARL6	Q9H0F7	186 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CA10	Q9NS85	328 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	C9orf170	A2RU37	121 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758		G3V3Q6	166 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ARPC5	O15511	151 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	NRAS	P01111	189 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CD59	P13987	128 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGA3	P26006	1051 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	MTCP1	P56278	107 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CLDN15	P56746	228 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	H2BFS	P57053	126 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PLGLB1	Q02325	96 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	OR1C1	Q15619	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF546	Q86UE3	836 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMF1	Q92530	271 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PIGT	Q969N2	578 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758		J3QW42	95 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM225B	P0DP42	221 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	RRAS	P10301	218 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	FAH	P16930	419 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF708	P17019	499 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF32	P17041	273 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINA2	P20848	420 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	VAMP1	P23763	118 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PLP2	Q04941	152 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXO1	Q12778	655 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	OR8B8	Q15620	311 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	LPAL2	Q16609	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SPSB4	Q96A44	273 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	PECR	Q9BY49	303 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	BCO1	Q9HAY6	547 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	RHOF	Q9HBH0	211 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	GLRX2	Q9NS18	164 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SOCS1	O15524	211 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	EFS	O43281	561 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SSX5	O60225	188 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	NME2P1	O60361	137 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	NEURL1	O76050	574 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CSN2	P05814	226 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	NME2	P22392	152 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SSTR2	P30874	369 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SOX8	P57073	446 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	ARPC4	P59998	168 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	BAMBI	Q13145	260 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2V2	Q15819	145 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TTLL3-222	ENST00000459758	CSRP2	Q16527	193 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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