RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GFERP55789 205 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDPQ00604 133 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 COTL1Q14019 142 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FLOT2Q14254 428 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C5orf47Q569G3 176 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TTC32Q5I0X7 151 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF691Q5VV52 312 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q6ZSR6 202 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRLF3Q8IUI8 442 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NECAP1Q8NC96 275 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF738Q8NE65 137 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR8G5Q8NG78 346 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RORBQ92753 470 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RILPQ96NA2 401 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZIM3Q96PE6 472 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMED9Q9BVK6 235 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC38A1Q9H2H9 487 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIGLEC7Q9Y286 467 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.31□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A0U1RQV1 116 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRBOX1C9JBD0 128 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD8AP01732 235 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MT-ND4P03905 459 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UGT2B10P36537 528 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HTR2BP41595 481 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDK5Q00535 292 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP24A1Q07973 514 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GUSBP1Q15486 140 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAPRE2Q15555 327 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMUG1Q53HV7 270 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MPV17L2Q567V2 206 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HBMQ6B0K9 141 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GUSBP11Q6P575 273 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OPN5Q6U736 354 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AHSA2Q719I0 299 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BBS7Q8IWZ6 715 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C12orf56Q8IXR9 622 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM9CQ8IZT9 166 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDXPQ96GD0 296 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARL5BQ96KC2 179 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BBS2Q9BXC9 721 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DIABLOQ9NR28 239 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.3□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRP4O75096 1905 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM131Q92545 1883 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1B0GVX0 72 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CENPBD1B2RD01 187 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLDN34H7C241 214 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 J3QT63 122 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SGCEO43556 437 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 E2F6O75461 281 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV3-11P01762 117 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APCSP02743 223 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GTF2H1P32780 548 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB38P57729 211 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2B6P58173 313 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ESRRGP62508 458 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PMS2P3Q13401 168 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM236Q5W0B7 351 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EPGNQ6UW88 154 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CYP4Z1Q86W10 505 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD302Q8IX05 232 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C15orf56Q8N910 161 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR5W2Q8NH69 310 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SUN5Q8TC36 379 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM159Q96B96 161 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDFIP1Q9BT67 221 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BEX2Q9BXY8 128 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRRQ9GZT4 340 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DSN1Q9H410 356 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa3.29□□□□□ -1.88
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms