RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF529Q6P280 563 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 COMMD2Q86X83 199 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC22A8Q8TCC7 542 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 C5orf34Q96MH7 638 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXL17Q9UF56 701 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SRPK3Q9UPE1 567 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 LILRA5A6NI73 299 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 M0R036 132 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FBP1P09467 338 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 PRF1P14222 555 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 BIDP55957 195 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXK1P85037 733 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SUSD2Q9UGT4 822 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 AP4M1O00189 453 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 JTBO76095 146 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN15O95858 294 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF20P17024 532 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FCGR2CP31995 323 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SNCAP37840 140 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM50BP56557 158 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 C20orf24Q9BUV8 137 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SCRT1Q9BWW7 348 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 SPACA1Q9HBV2 294 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 K7EPK0 472 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 AMY2BP19961 511 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 THBS4P35443 961 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM3AP98173 230 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.15■□□□□ 0.18
RALGPS1-208ENST00000424082 FIGNL2A6NMB9 653 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC14BO60729 498 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 ZP4Q12836 540 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 OPN5Q6U736 354 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5AS1Q8N127 324 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM24BQ8N5W8 94 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 OR1L3Q8NH93 324 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM234Q8WY98 164 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 MALSU1Q96EH3 234 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM3Q9BZL3 60 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CHST11Q9NPF2 352 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 RTTNQ86VV8 2226 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXW4P57775 412 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 GUK1Q16774 197 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 MIDNQ504T8 468 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM5Q6NVV9 412 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD8Q8NHS3 518 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 WNT16Q9UBV4 365 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 FRYLO94915 3013 aa16.14■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM33P57088 247 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 OR2B8PP59922 312 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB33BQ9H082 229 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF319Q9P2F9 582 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 AMDHD2Q9Y303 409 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 LHFPL6Q9Y693 200 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 MED12Q93074 2177 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 ARG1P05089 322 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CDAP32320 146 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 OR3A2P47893 321 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 COMMD1Q8N668 190 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 WDSUB1Q8N9V3 476 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 MAFIPQ8WZ33 124 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR1DQ9Y2S0 133 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.13■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 WRBO00258 174 aa16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 NME2P1O60361 137 aa16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RALGPS1-208ENST00000424082 OPN1LWP04000 364 aa16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms