RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409413.3

PRR35-201, Transcript of proline rich 35, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRR35, Length 2,216 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35-201ENST00000409413 C1orf123Q9NWV4 160 aa20.51■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 UMAD1C9J7I0 102 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 DEDDO75618 318 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SLC2A1P11166 492 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ID4P47928 161 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 HSD11B2P80365 405 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 DNM1P34Q6PK57 102 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 OR5D14Q8NGL3 314 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SGK3Q96BR1 496 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 LMO1P25800 156 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 TAS2R46P59540 309 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ZNF117Q03924 483 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 TGIF1Q15583 401 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 HEPN1Q6WQI6 88 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ZNF565Q8N9K5 539 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SLC26A10Q8NG04 563 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 PRRX2Q99811 253 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SLC35B3Q9H1N7 401 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 GSKIPQ9P0R6 139 aa20.5■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 IFNA2P01563 188 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 FOLR1P15328 257 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 GNALP38405 381 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ECI1P42126 302 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 TMEM33P57088 247 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 OR2B8PP59922 312 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SPEM2Q0P670 501 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ERV3-1Q14264 604 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 AADACL3Q5VUY0 350 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 DCXRQ7Z4W1 244 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 LFNGQ8NES3 379 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 UFSP2Q9NUQ7 469 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 H3BMH7 237 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ARL4DP49703 201 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ZNF84P51523 738 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 CD81P60033 236 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 Q3ZCU0 254 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 C1orf140Q5VVS0 124 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 OR2A2Q6IF42 318 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 OR13G1Q8NGZ3 307 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 CHST5Q9GZS9 411 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 KCNJ16Q9NPI9 418 aa20.49■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 S100A2P29034 98 aa20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 PARPBPQ9NWS1 579 aa20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 FAM206AQ9NX38 181 aa20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa20.48■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 A6NIZ1 184 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 NPIPB7O75200 414 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 H2BFMP0C1H6 154 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 RAP1BP61224 184 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 RAP1AP62834 184 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SQSTM1Q13501 440 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 PLAC9Q5JTB6 97 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 NCMAPQ5T1S8 102 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 COX15Q7KZN9 410 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 NICN1Q9BSH3 213 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 PRR13Q9NZ81 148 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 A0A0A6YYD4 124 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 A0A1W2PQM1 296 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SYT7O43581 403 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ITGA3P26006 1051 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 OR1L3Q8NH93 324 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 GINS3Q9BRX5 216 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 TMED3Q9Y3Q3 217 aa20.47■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 TTRP02766 147 aa20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SFTPBP07988 381 aa20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 AMY2BP19961 511 aa20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 HSD17B7P56937 341 aa20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 CCL7P80098 99 aa20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 CLINT1Q14677 625 aa20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 PYY3Q5JQD4 70 aa20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.46■□□□□ 0.87
PRR35-201ENST00000409413 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms