RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ICAM2P13598 275 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 TMEM11P17152 192 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 GDF1P27539 372 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 NHLH2Q02577 135 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 FOXO1Q12778 655 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 STUMQ69YW2 141 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 DRAM2Q6UX65 266 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A22Q9H936 323 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 NAT8Q9UHE5 227 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 FGF2P09038 288 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 CASP6P55212 293 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 FAHD2AQ96GK7 314 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OR10C1Q96KK4 312 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 GGACTQ9BVM4 153 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 PRSS50Q9UI38 385 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 PLSCR5A0PG75 271 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 M0R135 149 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 CIDEAO60543 219 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 GYPAP02724 150 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OR5AC1P0C628 307 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 FAHP16930 419 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 IFI44Q8TCB0 444 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ZNF799Q96GE5 643 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 F11P03951 625 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 BTG2P78543 158 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 EDDM3AQ14507 147 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 IL13RA2Q14627 380 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 MPV17LQ2QL34 196 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 RNF165Q6ZSG1 346 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 A0A0A6YYD5 115 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 A0A0B4J2E0 115 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GX12 115 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 LINC01553A4QN01 128 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 B4DEV8 164 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 REC114Q7Z4M0 266 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 DPF1Q92782 380 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 MCHR2Q969V1 340 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 K7ERU9 68 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OGG1O15527 345 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ABLIM3O94929 683 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 NRASP01111 189 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 TAS2R45P59539 299 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 DBX1A6NMT0 343 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 METTL12A8MUP2 240 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 M0R1X1 148 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OLFM2O95897 454 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 IGLV3-27P01718 113 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 FOXK1P85037 733 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 HFEQ30201 348 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 MORN4Q8NDC4 146 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 DDA1Q9BW61 102 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 NAA60Q9H7X0 242 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 GZMMP51124 257 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 OR5AS1Q8N127 324 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 NEU3Q9UQ49 428 aa8.78□□□□□ -1
HERC3-202ENST00000402738 RAB29O14966 203 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SPINT2O43291 252 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms