RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 PCSK5Q92824 1860 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 PMS2P2O95744 297 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 S100A11P31949 105 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 CLDN15P56746 228 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 CARD18P57730 90 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 SVILO95425 2214 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 M0R135 149 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 YKT6O15498 198 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 CBR3O75828 277 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 GABRR1P24046 479 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 ACKR3P25106 362 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 HOXA6P31267 233 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 CAPZA1P52907 286 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 ACER2Q5QJU3 275 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 ZNF799Q96GE5 643 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 MFFQ9GZY8 342 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.97□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 ATG12O94817 140 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 GDF1P27539 372 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 IL13RA1P78552 427 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 CDH26Q8IXH8 852 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 GJC3Q8NFK1 279 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC13-202ENST00000366662 DISC1C4P0D8 188 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 CD74P04233 296 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 ZNF529Q6P280 563 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 DYRK2Q92630 601 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 WDR13Q9H1Z4 485 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 BIN3Q9NQY0 253 aa14.96□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 SULT1C2O00338 296 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 JMJD7P0C870 316 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 CASRP41180 1078 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 ATP1B3P54709 279 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 RAC1P63000 192 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 DHODHQ02127 395 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 HFEQ30201 348 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 DOK3Q7L591 496 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 LNP1A1A4G5 178 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 FAM221AA4D161 298 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 FABP1P07148 127 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 CCL2P13500 99 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 RAB6AP20340 208 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 MPLP40238 635 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 ZNF546Q86UE3 836 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 OR10D3Q8NH80 312 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 PIGQQ9BRB3 760 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 UPB1Q9UBR1 384 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 C3AR1Q16581 482 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 RAB12Q6IQ22 244 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 LILRB2Q8N423 598 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 SGK3Q96BR1 496 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 TINAGQ9UJW2 476 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 OR5H14A6NHG9 310 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 LRRC3CA6NJW4 275 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 FAM166BA8MTA8 275 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 C3orf80F5H4A9 247 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 SGCEO43556 437 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 RLN2P04090 185 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 LCATP04180 440 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 CCNOP22674 350 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 PTGFRP43088 359 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 C2CD4CQ8TF44 421 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 CCDC107Q8WV48 283 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 PRR14LQ5THK1 2151 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TTC13-202ENST00000366662 MGMTP16455 207 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms