RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 ASB16Q96NS5 453 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 BEX2Q9BXY8 128 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 M0R1X1 148 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HCRTO43612 131 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 CLECL1Q8IZS7 167 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.43□□□□□ -1.7
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