RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340958.3

CLDN4-201, Transcript of claudin 4, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN4, Length 1,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-201ENST00000340958 CD37P11049 281 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 ATP1B3P54709 279 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 PRDX4Q13162 271 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 TRIQKQ629K1 86 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM42Q69YG0 159 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 FAM46BQ96A09 425 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 DIABLOQ9NR28 239 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 PLATP00750 562 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 RBP2P50120 134 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 FUT6P51993 359 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 ERVS71-1P61550 626 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 NAAAQ02083 359 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 RNF144BQ7Z419 303 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 LYPD6Q86Y78 171 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 HAVCR1Q96D42 359 aa14.92□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 ICMTO60725 284 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 CST4P01036 141 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM225BP0DP42 221 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 SELEP16581 610 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 CDK2P24941 298 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 GCH1P30793 250 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 PTGFRP43088 359 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 NR4A2P43354 598 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 EFNB2P52799 333 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 DEFA1P59665 94 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 DEFA3P59666 94 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 PLA2G7Q13093 441 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 CBX3Q13185 183 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 OR10K2Q6IF99 312 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 LRRC46Q96FV0 321 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 RADILQ96JH8 1075 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 SOSTQ9BQB4 213 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 RAB22AQ9UL26 194 aa14.91□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 UBBP0CG47 229 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 TUBG1P23258 451 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 CALCRP30988 508 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 ASCL1P50553 236 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 STEAP3Q658P3 488 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 ITPKCQ96DU7 683 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CLDN4-201ENST00000340958 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CTAG2O75638 210 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 IL7P13232 177 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RAC2P15153 192 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CCKARP32238 428 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 IFITM3Q01628 133 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 BAK1Q16611 211 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TRIM16LQ309B1 348 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SSX8Q7RTT4 187 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CST11Q9H112 138 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 A0A1B0GUH1 482 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 VSIG8P0DPA2 414 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 RAB6AP20340 208 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 FABP6P51161 128 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 SCN1BQ07699 218 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR8S1Q8NH09 359 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 PTX4Q96A99 478 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ABHD1Q96SE0 405 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 OR10A4Q9H209 315 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 GHRLQ9UBU3 117 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.89□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 ISPDA4D126 451 aa14.88□□□□□ -0.03
CLDN4-201ENST00000340958 XRCC3O43542 346 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms