RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TIGD4Q8IY51 512 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OSR2Q8N2R0 312 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD1Q8N668 190 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T27Q8NH04 317 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 NDNFQ8TB73 568 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SPSB4Q96A44 273 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 REEP6Q96HR9 211 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 C7orf26Q96N11 449 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ASCL2Q99929 193 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10A2Q9H208 303 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPMQ9NSP4 180 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RASL12Q9NYN1 266 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WUU8 490 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF878C9JN71 531 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC42EP2O14613 210 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ARPC3O15145 178 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 AKR7A2O43488 359 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 IDH3BO43837 385 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ECI1P42126 302 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB25P57735 213 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MXRA7P84157 204 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 IFI44LQ53G44 452 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF626Q68DY1 528 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LCN8Q6JVE9 175 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 MREGQ8N565 214 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T4Q8NH00 348 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ITFG2Q969R8 447 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ISOC1Q96CN7 298 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SDSLQ96GA7 329 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF170Q96K19 258 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TSSK2Q96PF2 358 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 NMNAT3Q96T66 252 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RHCGQ9UBD6 479 aa6.3□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC119BA6NIH7 251 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LY86O95711 162 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 LPLP06858 475 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PSG2P11465 335 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 AMY2BP19961 511 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 PAX6P26367 422 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNGR2P38484 337 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 IDH3AP50213 366 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 INSL3P51460 131 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 BLVRAP53004 296 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG3P63215 75 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM3AP98173 230 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FHL1Q13642 323 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT72Q14CN4 511 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC23BQ15437 767 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCA11PQ4W5N1 156 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T12Q8NG77 320 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 IL17DQ8TAD2 202 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 FANK1Q8TC84 345 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SEH1LQ96EE3 360 aa6.29□□□□□ -1.4
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.29□□□□□ -1.4
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