RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZFPL1O95159 310 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 RENP00797 406 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 PSKH1P11801 424 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 NOS3P29474 1203 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 GABRA2P47869 451 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 OMPP47874 163 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRKXP51817 358 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 MALSU1Q96EH3 234 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 FN3KQ9H479 309 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 NLKQ9UBE8 527 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.93□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR6C68A6NDL8 312 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 GNALP38405 381 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPIBQ01892 262 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMED1Q13445 227 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SSX2Q16385 188 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR4K13Q8NH42 304 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SGK3Q96BR1 496 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 KCNJ15Q99712 375 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 COPS4Q9BT78 406 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF222Q9UK12 451 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 LRP12Q9Y561 859 aa9.92□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 UNC119BA6NIH7 251 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ARPC3O15145 178 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 PSG2P11465 335 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF823P16415 610 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 CCL3L1P16619 93 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 DYNLT3P51808 116 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLC7A2P52569 658 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLC25A1P53007 311 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 DGCR2P98153 550 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 BNIP1Q12981 228 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 KLHL12Q53G59 568 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 DCXRQ7Z4W1 244 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 REEP6Q96HR9 211 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ASCL2Q99929 193 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 MICU1Q9BPX6 476 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SP140LQ9H930 580 aa9.91□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1W2PPH5 198 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1W2PRQ8 180 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 TBX1O43435 398 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ARG1P05089 322 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 DCTDP32321 178 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 GSK3AP49840 483 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 IL5RAQ01344 420 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 DGCR6Q14129 220 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR2T12Q8NG77 320 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 OR5P3Q8WZ94 311 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 TFAP2CQ92754 450 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SDSLQ96GA7 329 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 CENPMQ9NSP4 180 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 SCOCQ9UIL1 159 aa9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TIMMDC1-201ENST00000264244 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1W2PPE2 198 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1W2PR64 198 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1W2PRV1 198 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 TVP23AA6NH52 213 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM210A6NLX4 147 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 ODF3BA8MYP8 253 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF682O95780 498 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 NPPAP01160 153 aa9.89□□□□□ -0.83
TIMMDC1-201ENST00000264244 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms