RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 COMMD9Q9P000 198 aa7.21□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.21□□□□□ -1.25
VAMP3-201ENST00000054666 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 MPC2O95563 127 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 IGHV3-9P01782 118 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CELA3AP09093 270 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PATE4P0C8F1 98 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF708P17019 499 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 NAT1P18440 290 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 AGTR1P30556 359 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 S100A11P31949 105 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 OR3A3P47888 321 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 OR3A2P47893 321 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RBP2P50120 134 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 MEOX1P50221 254 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM50BP56557 158 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CLDN18P56856 261 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 IL13RA1P78552 427 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PPA1Q15181 289 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RSU1Q15404 277 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 MICBQ29980 383 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 METTL9Q9H1A3 318 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 IL17BQ9UHF5 180 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.21□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 KNTC1P50748 2209 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 OR2AT4A6NND4 320 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CDK2AP1O14519 115 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 NME2P1O60361 137 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RAD51DO75771 328 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CD46P15529 392 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 AKR1C4P17516 323 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CXCL2P19875 107 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 NME2P22392 152 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 GABRR1P24046 479 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ACKR3P25106 362 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 SORDQ00796 357 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 HGFACQ04756 655 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 SPEM2Q0P670 501 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PPP1R1AQ13522 171 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 STK11Q15831 433 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 SKA3Q8IX90 412 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TECTBQ96PL2 329 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PECRQ9BY49 303 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ARL6Q9H0F7 186 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CALHM2Q9HA72 323 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 FRYLO94915 3013 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 C9orf170A2RU37 121 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CA11O75493 328 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 HTR3BO95264 441 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 NRASP01111 189 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 IL2RAP01589 272 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 SP1P08047 785 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PPP3CBP16298 524 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ZBTB25P24278 435 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 FPR2P25090 351 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CD82P27701 267 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CLLU1Q5K131 121 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 HOGA1Q86XE5 327 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TERB2Q8NHR7 220 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 MARCH1Q8TCQ1 289 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 MITD1Q8WV92 249 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 FBXW5Q969U6 566 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 APH1AQ96BI3 265 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.2□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CFAP54Q96N23 3096 aa7.19□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.19□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.19□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 LINC00862A6NCI5 91 aa7.19□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF724A8MTY0 619 aa7.19□□□□□ -1.26
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