RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055006.11

Trim16-201, Transcript of Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim16, Length 3,906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim16-201ENSMUST00000055006 P01800 113 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hoxb5P09079 269 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 P18524 117 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Nme2Q01768 152 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 MestQ07646 335 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ces2fQ08ED5 561 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cobll1Q3UMF0 1273 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Amz2Q400C8 359 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hes3Q61657 175 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Il11ra1Q64385 432 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mvb12aQ78HU3 271 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 NarflQ7TMW6 476 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1282Q7TQY5 305 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 CblcQ80XL1 496 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Znf775Q8BI73 538 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Q8R3Y5 413 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Alg12Q8VDB2 486 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Nudt16l1Q8VHN8 211 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Letmd1Q924L1 360 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ubqln4Q99NB8 596 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Cep41Q99NF3 373 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 PsenenQ9CQR7 101 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Emc6Q9CQW0 110 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 4933400A11RikQ9CR52 288 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Il36bQ9D6Z6 183 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ing5Q9D8Y8 240 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Aurkaip1Q9DCJ7 200 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pcnx3Q8VI59 2028 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Igkv9-124A0A0G2JDR3 117 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hbb-bh2B2RVB7 147 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm15737D3YZR0 106 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 BC051665E9Q623 330 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm21818J3KMS6 170 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Raet1cO08604 253 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Stc2O88452 296 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tnfsf9P41274 309 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Galr1P56479 348 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pon3Q62087 354 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rsl1Q7M6Y1 485 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tacstd2Q8BGV3 317 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Klhl24Q8BRG6 600 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Bhlhe41Q99PV5 410 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 MyotQ9JIF9 496 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 C1galt1c1Q9JMG2 316 aa7□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Tet2Q4JK59 1912 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vps13aQ5H8C4 3166 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm35315A0A1B0GRI2 571 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r124D3YTX4 307 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r159K7N701 305 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Prrt1O35449 306 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Best1O88870 551 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rpl27P61358 136 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Esp1Q3LHH8 102 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm14851Q5ERJ0 116 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 DbpQ60925 325 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pafah1b3Q61205 232 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gpatch2Q7TQC7 527 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1283Q7TQY4 305 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1281Q7TQY6 305 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1148Q7TR35 314 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mogat2Q80W94 334 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Kiaa1456Q80WQ4 447 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Wdr48Q8BH57 676 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Las2Q8CB14 526 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 BivmQ8CBX9 502 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 AfmidQ8K4H1 305 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr661Q99NH4 319 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 PipoxQ9D826 390 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Actl6aQ9Z2N8 429 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 SpxD3Z752 116 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm4181E9Q7X3 184 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Vmn1r122K7N726 305 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Hmx3P42581 356 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rasl12Q08AT1 266 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 B4galnt1Q09200 533 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr733Q14AK5 308 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 March9Q3TZ87 348 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Mfsd4b3Q3UN21 355 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Commd3Q63829 195 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Sat2Q6P8J2 170 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Slc25a44Q8BGF9 314 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm9999Q8C5Y2 53 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 CcinQ8CDE2 588 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 C8gQ8VCG4 202 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr1466Q8VFW4 310 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 HypmQ9CR04 117 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rep15Q9D7T1 230 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Med29Q9DB91 199 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Prss22Q9ER10 306 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm5493S4R2D1 92 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Col9a3A2ACT7 680 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 FggyA2AJL3 552 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Olfr936J3KMV2 267 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 AF067061O70616 171 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gcnt2P97402 401 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Q80UB0 333 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Fam76bQ80XP8 339 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Rasgef1bQ8JZL7 473 aa6.99□□□□□ -1.29
Trim16-201ENSMUST00000055006 Neil1Q8K4Q6 389 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms