RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 COL6A6A6NMZ7 2263 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF850A8MQ14 1090 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 LDLRAD4O15165 306 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 RAC2P15153 192 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 TALDO1P37837 337 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 ART1P52961 327 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 PLA2G7Q13093 441 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T2Q6IF00 324 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 XKRXQ6PP77 449 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 MOB3CQ70IA8 216 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 ANGPTL5Q86XS5 388 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNPRQ8TBG9 265 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB40AQ8WXH6 277 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 SRRQ9GZT4 340 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK15Q9H427 330 aa21.38■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR3A4PP47883 348 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCXD3Q63HM9 321 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf87Q6PH81 154 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 HAVCR1Q96D42 359 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 GPER1Q99527 375 aa21.37■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPR160Q9UJ42 338 aa21.37■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM90A27PA6NNH2 459 aa21.36■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 CRYAAP02489 173 aa21.36■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRDX4Q13162 271 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 MADCAM1Q13477 382 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 IL18Q14116 193 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 AWAT2Q6E213 333 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa21.36■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRR7Q8TB68 274 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A11Q9UPY5 501 aa21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 LILRA1O75019 489 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 GNLYP22749 145 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 RBP2P50120 134 aa21.35■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 EFNB2P52799 333 aa21.35■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 TLE1Q04724 770 aa21.35■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa21.34■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 DTX3Q8N9I9 347 aa21.34■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 FBLN5Q9UBX5 448 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 MPC1Q9Y5U8 109 aa21.34■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 UPK1BO75841 260 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 NAT2P11245 290 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 MPV17P39210 176 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 PITPNBP48739 271 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 ZP1P60852 638 aa21.34■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 CEACAM21Q3KPI0 293 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf17Q53FE4 359 aa21.34■■□□□ 1.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 GDPD1Q8N9F7 314 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa21.34■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA1BQ00975 2339 aa21.33■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0G2JMP0 313 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0X1KG70 313 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-215ENST00000628018 VGLL3A8MV65 326 aa21.33■■□□□ 1
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