RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	LINGO2	Q7L985	606 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	GRINA	Q7Z429	371 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SMIM29	Q86T20	159 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SNX32	Q86XE0	403 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SMYD1	Q8NB12	490 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	OR10A6	Q8NH74	314 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	OR5R1	Q8NH85	324 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF563	Q8TA94	476 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	BBS10	Q8TAM1	723 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TAMM41	Q96BW9	452 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	RCN3	Q96D15	328 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF583	Q96ND8	569 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	DUX3	Q96PT4	197 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	CMTM6	Q9NX76	183 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768		A0A0B4J2E0	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GWA3	101 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1B0GX12	115 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF879	B4DU55	563 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	LRRN3	E7EW58	273 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SULT2B1	O00204	365 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	NME4	O00746	187 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	MRAS	O14807	208 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ANGPT2	O15123	496 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF208	O43345	1280 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ATP8B1	O43520	1251 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SYNGR1	O43759	233 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	PAH	P00439	452 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	HPR	P00739	348 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	IFNA6	P05013	189 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ETS2	P15036	469 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ARR3	P36575	388 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	DLX1	P56177	255 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ARL16	Q0P5N6	197 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SLC17A1	Q14916	467 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	PDK3	Q15120	406 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	REEP3	Q6NUK4	255 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	CADM2	Q8N3J6	435 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	PNKD	Q8N490	385 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM99	Q8N816	258 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM234	Q8WY98	164 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	RORB	Q92753	470 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TAAR8	Q969N4	342 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	WDFY2	Q96P53	400 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGDIG	Q99819	225 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	HHATL	Q9HCP6	504 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	CALML5	Q9NZT1	146 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA1456	Q9P272	454 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	IFT52	Q9Y366	437 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SORL1	Q92673	2214 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768		M0QX08	132 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	SNX3	O60493	162 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	AKR7A3	O95154	331 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	BGLAP	P02818	100 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	PNMT	P11086	282 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	COX4I1	P13073	169 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF35	P13682	527 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	HLA-DOB	P13765	273 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	PITPNB	P48739	271 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MLH1-223	ENST00000616768	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8

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