RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MEMO1Q9Y316 297 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNA1CQ13936 2221 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB27BO00194 218 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 RER1O15258 196 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB3DO95716 219 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB5AP00167 134 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 THBS4P35443 961 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 MEOX1P50221 254 aa22.22■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 ECH1Q13011 328 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 SGCAQ16586 387 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZTK2 550 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR84Q9NQS5 396 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 DHRS7CA6NNS2 312 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 TPOP07202 933 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 AGAP20933 346 aa22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH3B1P43353 468 aa22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 OR14K1Q8NGZ2 314 aa22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLK2P20151 261 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 PDSS1Q5T2R2 415 aa22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 UTS2BQ765I0 119 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 NLRC3Q7RTR2 1065 aa22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 PP6455Q8WZ26 134 aa22.21■■□□□ 1.15
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK15Q9H427 330 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC3CA6NJW4 275 aa22.2■■□□□ 1.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 STK11Q15831 433 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF584Q8IVC4 421 aa22.2■■□□□ 1.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 CARD18P57730 90 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 GGNQ86UU5 652 aa22.19■■□□□ 1.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR51S1Q8NGJ8 323 aa22.19■■□□□ 1.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 UCN2Q96RP3 112 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC22CQ9BRL7 303 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF69Q9UC07 566 aa22.19■■□□□ 1.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T35Q8NGX2 323 aa22.18■■□□□ 1.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 PHYHD1Q5SRE7 291 aa22.17■■□□□ 1.14
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CAPNS1-204ENST00000587718 SFXN2Q96NB2 322 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 BEX1Q9HBH7 125 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF391Q9UJN7 358 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-204ENST00000587718 ANAPC10Q9UM13 185 aa22.17■■□□□ 1.14
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